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【动物造模】-美沙拉秦干预下IBD小鼠结肠组织的转录组分析

  目的 应用转录组测序技术检测炎症性肠病小鼠结肠组织的基因表达变化,增进对美沙拉秦治疗IBD的分子机制的理解。

  方法 用葡聚糖硫酸钠建立IBD小鼠模型。 将 15只 C57BL/6小鼠随机均分为三组:对照组、DSS组和 DSS+5-ASA 组。 每组随机选择 3 只小鼠取结肠组织进行测序,经两组间比较,鉴定差异表达基因及重要生物学信号通路。 随后通过基因表达数据库中溃疡性结肠炎患者和经美沙拉秦治疗后患者结肠组织活检的微阵列数据,验证前面鉴定得到的子显著DEGs。

  结果 DSS+5-ASA组与DSS组比较中共得到2983个差异表达基因,上调基因 604个,下调基因753个;DSS组与对照组比较,共得到1626个差异表达基因,其中上调基因820个,下调基因806个。 GO(gene ontology)和KEGG富集分析结果显示,这些DEGs与免疫反应等信号通路有关。部分表达差异显著的基因如Rnase1 和Cxcl10,在UC患者结肠组织中有相似的表达趋势。

  结论 经美沙拉秦治疗的IBD模型小鼠结肠组织的基因表达谱,与IBD患者对比进行验证,得到数个IBD治疗过程中可能涉及的基因和生物学通路,增加了美沙拉秦对IBD治疗作用机制的进一步理解。

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