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【动物造模】-如何筛选小鼠后肢特异表达基因?

  目的:如何比较小鼠前肢基因表达谱的变化并筛选小鼠后肢特异性表达的基因?

  方法:利用NCBIGEO数据库搜索小鼠前肢基因表达芯片。然后,使用转录组分析控制台软件,将原始数据(5个前肢E10.5d芯片和4个后肢E10.5d芯片)进行质量控制,并将差异乘以大于或小于0.5倍。使用和使用P值小于0.05用于数据过滤,绘制差异表达基因的火山图,通过聚类分析绘制后肢特异性表达基因的相互作用分子网络图?

  结果:与包含45个上调基因和230个下调基因的前肢相比,小鼠胚胎E10后肢有275个差异表达基因。5d。后肢特异表达的差异基因的分子网络图谱,找到后肢特异表达的核心基因,用qPCR检测一些基因,与芯片结果一致吗?

  结论:小鼠表达谱芯片成功筛选后肢特异性表达。

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