动物造模,Fkbp51基因敲除 中国实验动物信息网 2021-09-23 1391

　　目的：研究Fkbp51敲除（KO）和野生型（WT）小鼠肝脏表达谱对肝组织基因可变剪接的影响。

　　方法：采用二代测序对Fkbp51KO和WT小鼠肝脏表达谱进行测序，采用TopHat对KO和WT小鼠的RNA测序结果进行选择性剪接分析，筛选肝组织内含子保留的差异。 ,I) 和外显子跳跃 (SE)。使用在线工具 DAVID，对这些不同的选择性剪接体进行基因本体 (GO) 和代谢途径 (kyotoencyclopediaofgenesandgenomes，KEGG) 富集分析，同时使用CBI 基因数据库对这些基因进行注释。

　　结果：（1）Fkbp51缺失可引起小鼠肝脏mRNA选择性剪接变化；（2）Fkbp51基因敲除引起小鼠肝脏mRNA选择性剪接表达变化；3）通过GO和KEGG分析，这些基因的选择性剪接主要是与代谢、免疫、胆汁酸分泌和其他脂肪相关衍生物的途径有关。 (4)与不同内含子保留相关的基因主要与肌动蛋白细胞骨架的调节和氨基酸及其衍生物的代谢有关。

　　结论：Fkbp51基因敲除会改变基因组中mRNA的可变剪接，从而影响小鼠肝脏的代谢功能。